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人腫瘤circRNA PCR芯片


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    PCR ARRAY介紹

    PCR ARRAY又稱PCR芯片,運用高通量熒光定量PCR方法,在一張96孔或384孔板上同時對某個信號通路或疾病相關(guān)基因的表達量變化進行檢測,芯片上的基因包括了與研究對象有確定關(guān)系的基因或者待考證的基因;目前啟因生物針對不同的信號通路和疾病相關(guān)基因設(shè)計了150多款功能分類PCR芯片,涵蓋生命科學(xué)研究的各個領(lǐng)域。

    人腫瘤circRNA PCR芯片介紹

        circRNA 與腫瘤 TNM 分型密切相關(guān)。circRNA 通過調(diào)控大量信號通路與腫瘤細胞的增殖、凋亡以及轉(zhuǎn)移密切關(guān)聯(lián),另外還能通過細胞外囊泡(e.g. 外泌體,納米微粒)進行轉(zhuǎn)運,并且circRNA 具有低分子量、較好的穩(wěn)定性與保守性的特點,因此,circRNA 具有作為治療腫瘤的藥物靶點或載體的潛能。啟因生物的人腫瘤circRNA PCR ARRAY含有94個人腫瘤circRNA 相關(guān)基因,包含乳腺癌,食管癌,非小細胞肺癌,肝癌,胃癌,膀胱癌,骨肉瘤,膠質(zhì)瘤等數(shù)十種腫瘤或癌癥類型。

    產(chǎn)品說明

    產(chǎn)品名稱

    腫瘤circRNA PCR芯片

    貨    號

    sp-TWCPAHM-0012

    基因數(shù)目

    94

    基因名稱

    見基因列表

    檢測費用

    1000/

    樣本類型

    細胞,組織等

    項目周期

    2周(不含節(jié)假日)

    實驗結(jié)果

    原始數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)分析

    技術(shù)原理

    *相對定量,SYBR Green

    *相對定量:用于測定一個測試樣本中目標(biāo)基因與校正樣本中同一基因表達的相對變化。校正樣本可以是一個未經(jīng)處理的對照或者是在一個實驗研究中處于零時的樣本。

    服務(wù)特點

    1. 只需提供樣品

    2. 數(shù)據(jù)分析多樣性選擇

    3. 中低通量,一次性檢測多個相關(guān)基因的表達水平

    4. 周期短

    5. 結(jié)果不需要qPCR驗證

    服務(wù)流程

    1. 確定實驗方案,簽合同

    2. 樣品寄出(-80℃順豐寄出)

    3. 收樣后進行質(zhì)控

    4. 質(zhì)控過關(guān),上機檢測

    5. 數(shù)據(jù)分析

    樣品預(yù)處理方法

    為了避免樣品中RNA降解,需對樣品進行預(yù)處理。

    樣品類型

    處理方法

    送樣量

    貼壁細胞

    倒出培養(yǎng)液,用 1×PBS 清洗一次。
    10 cm2生長的培養(yǎng)細胞中加入 1-2 ml trizol,輕微晃動,確保使裂解液均勻分布于細胞表面。將內(nèi)含細胞的裂解液轉(zhuǎn)移至離心管中,-80℃保存

    至少1×106個細胞

    懸浮細胞

    將懸浮培養(yǎng)細胞連同培養(yǎng)液一起倒入離心管中,8,000 g 4℃離心2 分鐘,棄上清。
    向細胞中加入 1 ml trizol,-80℃保存

    至少1×106個細胞

    組織(動物器官類)

    離心管中加1 ml trizol,確保浸沒組織,-80℃保存

    至少20mg,約小黃豆大小

     

    檢測流程:

    1. 樣品總RNA提取

    2. RNA質(zhì)量檢測,檢測RNA純度及完整度,提供RNA質(zhì)量報告;

    3. cDNA合成,使用逆轉(zhuǎn)錄酶,將樣品RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA

    4. 實時定量PCR反應(yīng);

    5. 數(shù)據(jù)分析,計算PCR芯片中的各個Ct值,采用ΔΔCt方法比較基因的表達變化,并利用公司自主開發(fā)的數(shù)據(jù)分析軟件進行比較。

     

    基因列表 

    hsa_circ_0001445

    hsa_circ_0001189

    hsa_circ_0003222

    hsa_circ_0001283

    hsa_circ_0002111

    hsa_circ_0002260

    hsa_circ_0003707

    hsa_circ_0001824

    hsa_circ_0004458

    hsa_circ_0024108

    hsa_circ_0006022

    hsa_circ_0001875

    hsa_circ_0004771

    hsa_circ_0036722

    hsa_circ_0006633

    hsa_circ_0004619

    hsa_circ_0015278

    hsa_circ_0058106

    hsa_circ_0014717

    hsa_circ_0006054

    hsa_circ_0021553

    hsa_circ_0058107

    hsa_circ_0047905

    hsa_circ_0006528

    hsa_circ_0064557

    hsa_circ_0007874

    hsa_circ_0054971

    hsa_circ_0008717

    hsa_circ_0067103

    hsa_circ_0000130

    hsa_circ_0057104

    hsa_circ_0008945

    hsa_circ_0078738

    hsa_circ_0000497

    hsa_circ_0058766

    hsa_circ_0018293

    hsa_circ_0079891

    hsa_circ_0001649

    hsa_circ_0060108

    hsa_circ_0005273

    hsa_circ_0016347

    hsa_circ_0001727

    hsa_circ_0063561

    hsa_circ_0007158

    hsa_circ_0013339

    hsa_circ_0003570

    hsa_circ_0069131

    hsa_circ_0041103

    hsa_circ_0000284

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    hsa_circ_0081146

    hsa_circ_0061265

    hsa_circ_0023404

    hsa_circ_0005075

    hsa_circ_0084720

    hsa_circ_0082582

    hsa_circ_0013958

    hsa_circ_0005986

    hsa_circ_0085553

    hsa_circ_0002768

    hsa_circ_0003028

    hsa_circ_0000594

    hsa_circ_0089548

    hsa_circ_0075825

    hsa_circ_0007915

    hsa_circ_0004383

    hsa_circ_0091742

    hsa_circ_0075828

    hsa_circ_0013255

    hsa_circ_0000026

    hsa_circ_0138960

    hsa_circ_0075829

    hsa_circ_0054345

    hsa_circ_0000140

    hsa_circ_0000069

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    hsa_circ_0061893

    hsa_circ_0000181

    hsa_circ_0020397

    hsa_circ_0017446

    hsa_circ_0070963

    hsa_circ_0000190

    hsa_circ_0000098

    hsa_circ_0035381

    hsa_circ_0071410

    hsa_circ_0000745

    hsa_circ_0000732

    hsa_circ_0058058

    hsa_circ_0072088

    hsa_circ_0001895

    hsa_circ_0000893

     

    hsa_circ_0072765

    hsa_circ_0003159

    hsa_circ_0000911

     

     

    更多芯片基因列表可上www.pcrarray.cn查詢

     

    參考文獻

    Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)

    Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)

    Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.IF6.065

    公司地址:

    城北路1355號上海大學(xué)科技園A901

    Q     Q:  2850925266 / 2850925265

    電    話:

    0212-63935065

     

     

    官    網(wǎng):

    www.wcgene.com

     

     

     

     

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  • 實驗管理
  • 2019-03-29
  • 醫(yī)學(xué)檢驗

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